按照国家发展改革委《关于煤层气价格管理的通知》(发改价格［2007］826号)，目前国内煤层气气价由供需双方协商确定，不实行国家定价。这给煤层气带来更大的定价空间。但是，从实际操作来看，目前国内煤层气气价基本上还是参照天然气气价。因此我国天然气定价中存在的问题也将影响到煤层气产业的发展。
我国天然气需求构成是城市燃气、工业原料、化工和电力。国内天然气需求增加最快的是城市燃气，由于这种需求的价格弹性很小。因此，国内天然气消费是卖方市场。
我国现行天然气价格仍然由国家统一定价，实行国家直接调控管理的体制。天然气气价由出厂价和管输费两部分组成。目前，我国天然气终端销售价格由天然气出厂价格、长输管道的管输价格、城市输配价格三部分组成。天然气出厂价格目前实行政府指导价，由国家发改委制定出厂基准价格，供需双方可在上下10%的范围内协商确定。跨省的长输管道的管输价格由国家发改委制定，省内的长输管道的管输价格和城市输配价格由各省省级物价部门制定。
我国天然气价格的管理部门是国家发改委和地方物价部门。天然气出厂价、管输费由发改委制定，城市配送服务费由地方政府下属的物价部门管理。
长期以来，我国天然气价格完全由政府决定，主要采用成本加成法。天然气价格长期背离市场价值。根据广东燃气商会的统计资料，2006年我国天然气管道井口价仅为同期美国、日本的压缩天然气到岸价的29%;终端销售价约0.28元/kcal，比同热值进口液化气终端销售价格低45%。按热值计算，我国天然气价格大大低于替代燃料，如电、原油和液化气的价格。据测算，天然气热值为8000cal/m3，与原油、液化气的热值比分别为1∶1.15∶1.38。2006年，我国原油一、二档平均价格为1020元/t，计划内液化气价格为1200元/t。按照同等热值计算，与原油的比价，天然气价格应为887元/1000m3;与计划内液化气的比价，天然气井口价格应为870元/1000m3。我国现行天然气井口价格仅仅比煤价略高，明显低于同等热值的原油、液化气价格。天然气非市场化的低价格导致了对天然气的过度使用和资源不合理配置，相当程度上造成了资源浪费。如果直接进口化肥或进口氨生产化肥可能更便宜。使用天然气生产化肥而不是用它替代高成本的或进口的天然气，会附带有很高的机会成本。依靠进口的天然气发电，同时拒绝进口较便宜的氨，而且氨更容易储存。天然气生产商被迫以最低的价格把气卖给化肥厂，也打击了生产商的经济性［156］。如我国对现行化肥用气实行低价和计划配额政策，导致天然气企业亏损。2002年西南油气田分公司供应化肥生产用气406586×104m3，和工业用气相比减少销售收入5.48亿元，当年该公司亏损6.41亿元。由于化肥用气计划配额限制了天然气向高附加值行业流动，是该公司发生亏损的主要原因之一。目前，以天然气为原料的尿素生产成本平均已在1200元/t左右，化肥厂生产1t尿素耗气约在600m3。2007年11月8日，国家发改委发布了《关于调整天然气价格有关问题的通知》，提高了工业用天然气出厂基准价格，将工业用户天然气的出厂基准价格每千立方米均提高400元，供化肥用气出厂基准价格不调整，所以化肥生产企业将继续使用相对便宜的天然气。以川渝气田为例，在未调价之前，工业用气和化肥用气的出厂基准价分别为875元/1000m3和690元/1000m3，调整后工业用气基准价已达到1275元/1000m3，而化肥用气仍然为690元/1000m3(表8－1)，二者相差585元/1000m3［157］。
表8－1 全国主要油田化肥用气基准价［157］ 单位:元/1000m3
国际上尿素以天然气为原料的占80%，因此国内以天然气为原料的化肥企业和国际化肥企业比较，美国的尿素吨耗天然气成本在182.3美元，国内的为82.8美元，二者相差近100美元。
近来，我国天然气价格改革已逐步提上议事日程，价格信号是天然气利用政策的一个重要组成部分，对天然气使用以及供需管理发挥着重要作用。由于现行天然气价格较低，造成目前供需矛盾十分突出，尤其是供暖季节，因此，天然气价格市场化改革是一个必然的趋势。
依据国际上天然气价格形成机制的变化趋势分析，我国天然气出厂价格也将逐步市场化。同时可以预计，天然气管输价格在一段时间内仍将实行管制。自2007年10月以来，国际天然气的价格在不断上升，我国关于能源价格改革也提到议事日程，预计国内天然气价格也会上升。随着天然气价格的改革，煤层气价格会作出相应调整。从长远看，国家应当建立天然气和原油价格适度联动的定价机制，以推动煤层气产业更加健康快速的发展。
